| 관장실 | 기관 업무 총괄 | 054-530-0800 |
| 기획부 | 경영전략·예산·국회 대응 | 054-530-0710 |
| 성과혁신부 | 홍보·성과평가·ESG 경영 | 054-530-0720 |
| 인사총무부 | 인사·근태·행정 지원 | 054-530-0732 |
| 전시부 | 전시 기획 및 전시관 운영 | 054-530-0770 |
| 전시문의(예약) | 전시해설·단체관람 | 054-530-0780 |
| 교육부 | 생물다양성 교육프로그램 | 054-530-0790 |
| 교육문의(예약) | 교육프로그램 신청 | 054-530-0766 |
| 담수생물연구본부 | 연구본부 업무 총괄 | 054-530-0801 |
| 동식물연구부 | 담수 동식물 조사·발굴 | 054-530-0810 |
| 원핵생물연구부 | 미생물 자원 확보·연구 | 054-530-0840 |
| 생물소재연구부 | 자원 활용 기술 개발 | 054-530-0870 |